Как вариант прописать явно z-index для backdrop (затемнения) и для модалки.
Но я в данном случае склонен думать, что это частный случай. Может быть расширения какие-то в виде adblock и подобной ерунды. Если не получается воспроизвести хотя бы на еще одном устройстве - надо брать этот ipad и сносить по очереди расширения, обновлять браузер и т.д.