Схлопыватели прозрачности - это пресеты для препресса и вывода файла на печать. Некоторое оборудование не умеет работать с прозрачностями и эффектами в макете, поэтому всё эти плюшки обычно преобразуют в чистый вектор и растр.
Баланс растра и вектора позволяет указывать, хочешь ли ты чтоб макет по максимуму оставался векторным или же можно всё в растр слить.
Высокое разрешение линий и текста необходимо, чтобы мелкие детали не превратились в пиксельную кашу.
Низкое разрешение градиентов полезно для их качественной печати. Это особенность технологий печати - градиенты традиционно плохо печатаются (лесенками/ступеньками), поэтому приходится изголяться (например зашумлять градиент или применять к нему дизеринг, это классический приём).
Но когда впадлу вылизывать все градиенты - может помочь тупо задать им низкое разрешение, и благодаря растискиванию краски в точках отпечатка - градиент как бы смажется сам при печати, и будет типа плавным.
Clip complex regions загоняет сложный рисунок с вектором и спецэффектами в маску (Clipping mask), внутри которой помещается растровый рендер исходника, как правило.
Anti-alias - ну это просто, обычное сглаживание растровых объектов (чтобы избежать пиксельных ступенек при перегоне из вектора в растр).
Вообще эта панелька для кропотливых препрессеров, вынужденных обслуживать какое-то уж очень требовательное оборудование. Препресс здорово автоматизируется стандартами PDF-X/A. Однако иногда эти пресеты выручают. Например, мне нередко приходилось готовить многостраничные издания для типографий, которые требовали, чтобы все шрифты были в кривых. Вместо того, чтобы вручную кривить все тексты (а для этого приходилось на каждой страницы всё выделять и предварительно разгруппировывать объекты и разблокировывать слои) - я кидал на самый нижний слой прозрачную плашку, создавал схлопыватель прозрачности с балансом 100% вектора и указывал этот пресет в настройках экспорта PDF - вуаля, одной кнопкой все текстовые объекты на всех страницах переводились в кривые.