Если используется баш, то судя по всему установлен и openssh. Он формата ppk, не понимает. Можно ppk конвертировать в pem, через PuTTYgen (
“Conversions”->”Export OpenSSH key”, через графическую тулзу
https://the.earth.li/~sgtatham/putty/latest/x86/pu... в видне, или
puttygen private-key.ppk -O private-openssh -o private-key.pem через консоль в *nix системах), после чего скормить ssh клиенту, как правило в ~/.ssh/id_rsa.
Ну или действительно пользовать путти.