LTS — это Long-Term Support, то есть очень стабильная ветка, в которой заведомо нет никаких изменений, только патчи безопасности, то есть сколько ни обновляй версию (в рамках 4.х), сервис не сломается. Это имеет смысл для проектов находящихся в стадии «работает — не трогай», для проектов в активной разработке веселее брать активно развивающуюся ветку.
Однозначно 5 — лучше поддержка ES2015 и производительность. К тому же буквально через пару недель выйдет 6, которая тоже будет LTS, и перейти на нее с пятерки всяко будет глаже, чем с 4.