Это особенность метода GetArray.
Чтобы избавиться от них нужно либо самому собирать массив, либо пересобрать имеющийся.
Я пересобираю так:
foreach($arXml['feed']['#']['entry'] as $keyEntry => $arValue) {
foreach($arValue['#'] as $sKey => $sVal) {
if(is_array($sVal[0]['#']['properties'][0]['#'])) {
foreach($sVal[0]['#']['properties'][0]['#'] as $keyProp => $valProp){
$arResult[$keyEntry][$keyProp] = $valProp[0]['#'];
}
}
}
}
У вас значения ключей feed, entry, properties могут быть другими либо отсутствовать.