запустите родную установку драйверов через setup.exe
Там, кроме драйверов (рекомендую, кстати, переустановить виа драйвера с неё) есть утилитка "kyocera client tool"
устанавливаете её, запускаете и настраиваете параметры сканирования.
Можно настроить три разных профиля сканирования для кнопок на панели с автосохранением в разные нужные папки для облегчения пользования - в дальнейшем (при запущенной client tool) все сканируется выбором программы и нажатием кнопки старт.
Для "ручного сканирования" используйте соответствующие программы. (см. пояснение от @SyavaSyava)
Даже "факсы и сканирование"(windows 7 и выше, встроена) умеют в png\bmp\jpg
Можно также посоветовать vuescan