Только написать код, который будет обновлять другую переменную (константу?) и обновлять их одновременно.
Либо по времени последней модификации файла (если записть происходит только при изменении переменной, а не при каждом обращении).
Собственно, всё.
Заведите переменную так:
$last_add_date = ((floor(($day-1)/3)) * 3 + 1);
$var += $increment * floor(($day-1)/3);
Собственно, в переменной $last_add_date будет _календарный_ номер дня.
Банальщина? Ещё какая.
Можно было просто взять готовую таблицу и играть с индексами, наверное.