Можно использовать
фильтр drop-shadow. Правда, поддержка у этой фичи пока не очень большая. Это если вы хотите сохранить логотип в векторе - тогда тень придется добавлять динамически через css - векторная графика не предназначена для теней и подобного. Однако учтите, что для этого вам необходимо вставить svg на страницу как текст (
способы), чтобы иметь возможность использовать селекторы.
А если вам нужен просто логотип с тенью, при этом не важно, в каком он формате, используйте png (можно 2 версии, под ретину) и не заморачивайтесь. В большинстве случаев svg не является необходимым решением.