Это противоречие.
CMS потому и CMS, то берут на себя работу по логической организации сайта, сохраняя в БД так, как им, CMS, виднее.
Не найдейтесь ни на какую автоматику, на то, что кто-то как-то сам поймет.
А вот преобразовать в вид, соостветствующий формату CMS - можно.
Или экспортировать, преобразовать, импортировать
Вопрос только в объемах.
Если объемы не очень значительны - имеет смысл вручную перебить заново все данные.
При большие - автоматизация, да.