Возможно вы неправильно инициализируете highlight.js...
Когда инициализируете только лишь посредством этой строки:
hljs.initHighlightingOnLoad();
То необходимо установить его после HTML разметки, в противном случае ничего сработает.
Либо делайте проверку на загрузку страницы при помощи
window.onload:
window.onload=function(){
hljs.initHighlightingOnLoad();
}
Либо при помощи других библиотек, например, Jquery:
$(document).ready(function() {
hljs.initHighlightingOnLoad();
});
То есть инициализируем highlight, только после полной загрузки html-документа.
Попробуйте на codepen.io обернуть инициализацию в функцию ожидания загрузки страницы и все должно заработать.
P.S. Хотя по идеи должно работать и так, и так, если верить документации, но у меня не работало, когда я вызывал функцию до html разметки.
