Помимо всего вышепереисленного - запускать питоньи программы можно не заходя в PyCharm. Просто запустите на выполнение ваш main-файл. Если питон есть в переменных среды - то достаточно даблклика по файлу. Если нет - ну напишите батник с текстом вида
C:\Python2.7\python.exe main.py и положите возле вашего main-файла.
Под main-файлом имеется ввиду файл с гипотетической точкой входа.