прежде всего, нужно скачать IDE
https://www.jetbrains.com/pycharm/ Community Edition вполне достаточно
затем в File - Settings - Project:name - Project Interpreteur проверить установленные модули: должен быть pip, должен быть Setuptools, если чего-то нет - доставить без IDE из командной строки
остальные модули (большинство) ставятся из этого же меню
некоторые - те, что компилируются и вообще тяжелые - могут ставиться только из командной строки, имей в виду
дальше плюсик справа - добавляешь Flask и все заверте...