1) соглашусь с
Алексей Николаев , если данных немного, и это именно development-данные (т.е. тестовые наборы данных), то миграции подойдут как нельзя лучше;
2) если же все-таки речь идет о живых данных, то у Оракла есть Oracle Workspace Manager, который отвечает на ваш вопрос "как быть с данными?". Разумеется это компонент Oracle Database, о самостоятельных open-source решениях аналогах не слышал.