Я бы сделал так. Поскольку в Windows буквы дискам можно назначать достаточно произвольно, открыл бы Управление дисками и назначил бы С тому разделу, который собираюсь сделать активным. Затем запустился бы с посторонней ОС (например, с любого инструментально-восстановительного LiveCD/LiveUSB), в нём запустил бы любой менеджер разделов (Акронис ДД, Парагон ХДМ и т.п.) и с его помощью назначил бы активным разделом тот, у которого перед тем менял букву. Кстати, раз уж менеджер разделов запущен, тут же можно и удалить ненужные разделы, и слить их (ограничиваться для этой работы только прогой EaseUS Partition Master вовсе необязательно). Затем рестарт, и запуск произойдёт уже с него.
Если Винда после рестарта распорядилась по-своему и снова поменяла разделам буквы, снова открыл бы Управление дисками и восстановил С на нужном разделе.