Файлы, из которых состоит шаблон могли быть пересохранены в неверной кодировке. В таком случае вы выставляете для браузера одну, а по факту сервер отдает ему другую. Поэтому и может появляться косяк. Но это не факт.
А пересохранить, откройте файлы шаблона через Notepad++ и поставьте кодировка UTF-8 без BOM и с сохранить.