Пока не задал ни одного вопроса... только отвечаю.
Этож open-source, можно же посмотреть в исходниках... Но обычно Linux раскидывает по нескольким директориям. Несколько в /usr и одну папку в /etc, скорее всего даже /etc/gigablast. Вот как раз в /etc/gigablast и можно посмотреть где лежат основные файлы.