А теперь подумайте о тех бедалагах, которые помимо того что пользуются ущербными браузерами, так им еще приходится процесить CSS на каждый запрос к вашему сайту. И ради чего? ради того что бы пользователи нормальных браузеров могли сэкономить пол килобайта. gzip устраняет кучу дублирования в css, а разница в плане времени разбора css незначительна.
Так что берем в руки autoprefixer и делаем прекомпиляцию на сервере, + сервим в gzip + кеширование.
--- updated ---
Сори, попутал с transform в css файликах.
Для js ничего предложить не могу, только такое:
www.kirupa.com/html5/vendor_prefixes_javascript.htm