Ну тут все просто, вы инициализируете плагин для элемента у которого стоит свойство
display: none;. В связи с чем скрипт не может получить размеры блока. Для того чтобы
jscrollpane заработал на таком элементе необходимо вызывать его с ключом
autoReinitialise и поместите этот код в $(document).ready().
В итоге будет как-то так:
$(document).ready(function() {
$('.scroll-pane').jScrollPane({
autoReinitialise: true
});
});