архивы не останутся, они будут распакованы. Родительский каталог можно указать вместо точки в данной команде, или просто зайти в него и выполнить команду "как есть".
Наизусть команду не воспроизведу, поэтому схематически, чтобы кривые руки еще раз не сделали свое черное дело: find от . найти все файлы *.gz и выполнить над ними распаковку.
Подробности см. в статьях про find и в его документации - объяснений в рунете море