Вопрос закрыт, проблема решена.
Сайт переставал работать когда я удалял зараженный файл из каталога libriares. Антивирус при открытии файла с сервера его удалял, я переименовал расширение в неизвестное, открыл, очистил его от тех кусков кода которые явно были лишними, залил обратно, переименовал обратно и всё работает)
А вот такие файлы как тот что я скинул, это сущий ад который можно смело удалять ибо он вообще никакого отношения к сайту не имеет.
Охренительная новость!!! Сканировал сайт после всего этого ужаса который с ним приключился и обнаружил ещё несколько, а точнее кучу зараженных файлов датированых установкой системы. Короче если в кратце то сайт joomla.ru (Именно там я скачивал установщик Joomla версии 2.5.19) распространяет зараженные версии CMS. Будьте бдительны!