Дело в режиме основного цвета - у вас скорее всего CMYK стоит, а вы сохраняете в RGB. То есть рисунок в одном цветовом режиме (к примеру для печати), а сохраняется в другом (для экрана) без преобразования профиля. Как вариант включать вместе с файлом параметры цветопробы (ICC-профиль). Вообщем копайте в сторону цветов...