Да, сохраняй содержимое хомяка и вперед. На самом деле проблемы конечно будут ;)
oia прав. Ставим виртуалку, туда целевую OS, перетягиваем туда ~. Решаем там проблемы с программами и параметрами. Все отстраиваем. Потом сохраняем куда-нибудь оригинальный хомяк от Ubuntu, устанавливаем Elementary OS, запускаем ту же виртуалку и вынимаем оттуда уже перенастоенный под Elementary OS домашний раздел, и вставляем в живую машину. Понимаем, что в жизни Elementary OS гораздо более убога чем в презентации и не такая уж элементарная, зато глючная, сносим. Накатываем Ubuntu. Заливаем в нее заранее сохраненный оригинальный home. PROFFIT??? LOSS!!!11