Задать вопрос
@cthulhudx
базы-данных

Секвенированные геномы. Откуда достать?

Скажите пожалуйста, есть ли базы геномов + исходных ридов. Пишу(для себя) геномный ассемблер, и мне нужно на чем-то проверять его работоспособность.
  • Вопрос задан
  • 3211 просмотров
Комментировать
Подписаться 1 Оценить Комментировать
Помогут разобраться в теме Все курсы
  • Яндекс Практикум
    Инженер по тестированию
    5 месяцев
    Далее
  • Thinknetica
    Профессиональная разработка на Ruby on Rails
    9 месяцев
    Далее
  • Специалист.ру
    Основы программирования и баз данных
    1 месяц
    Далее
Решения вопроса 3
@vilgeforce
Раздолбай и программист
www.ncbi.nlm.nih.gov/genome - оно? Если да - проверяйте настройки гугла, ибо это первый результат по запросу "genome database"
Ответ написан
Комментировать
Комментировать
amark
@amark
rush less, feel more
www.ncbi.nlm.nih.gov
ncbi + подразделы
Ответ написан
Комментировать
Комментировать
mr_more_distortion
@mr_more_distortion
Мол.биолог/иммунолог/биоинформатик(учусь)
ftp://ftp.ensembl.org/pub/

Выбираешь любой релиз и папочку FASTA. А смотря какой геном нужен. Если нужны риды (формат *.fastq) - искать в публикациях по таким темам, это в NCBI. Если какие-то собранные/недособранные геномы - это в ensembl всё есть.
Ответ написан
Комментировать
Комментировать
Пригласить эксперта
Ваш ответ на вопрос

Войдите, чтобы написать ответ

Похожие вопросы
Вакансии с Хабр Карьеры
Разработчик WebRTC-сервисов на Go в видеоплатформу
Яндекс • Москва
от 300 000 до 490 000 ₽
Personal Assistant с AI-фокусом (70% бизнес-задачи / 30% личные поручения)
Nexpanse Inc • Москва
от 200 000 ₽
HRD / People & Operations Manager (SaaS, AI)
Nexpanse Inc • Москва
от 450 000 ₽
Ещё вакансии