Все сервисы Хабра
Сообщество IT-специалистов
Ответы на любые вопросы об IT
Профессиональное развитие в IT
Закрыть
Задать вопрос
cthulhudx
@cthulhudx
Базы данных
Биотехнологии
Биоинформатика
Секвенированные геномы. Откуда достать?
Скажите пожалуйста, есть ли базы геномов + исходных ридов. Пишу(для себя) геномный ассемблер, и мне нужно на чем-то проверять его работоспособность.
Вопрос задан
более трёх лет назад
3209 просмотров
Комментировать
Подписаться
1
Оценить
Комментировать
Facebook
Вконтакте
Twitter
Решения вопроса
3
Владимир Мартьянов
@vilgeforce
Раздолбай и программист
www.ncbi.nlm.nih.gov/genome
- оно? Если да - проверяйте настройки гугла, ибо это первый результат по запросу "genome database"
Ответ написан
более трёх лет назад
Комментировать
Нравится
1
Комментировать
Facebook
Вконтакте
Twitter
Артур К.
@amark
rush less, feel more
www.ncbi.nlm.nih.gov
ncbi + подразделы
Ответ написан
более трёх лет назад
Комментировать
Нравится
Комментировать
Facebook
Вконтакте
Twitter
Александр Резвых
@mr_more_distortion
Мол.биолог/иммунолог/биоинформатик(учусь)
ftp://ftp.ensembl.org/pub/
Выбираешь любой релиз и папочку FASTA. А смотря какой геном нужен. Если нужны риды (формат *.fastq) - искать в публикациях по таким темам, это в NCBI. Если какие-то собранные/недособранные геномы - это в ensembl всё есть.
Ответ написан
более трёх лет назад
Комментировать
Нравится
Комментировать
Facebook
Вконтакте
Twitter
Пригласить эксперта
Ответы на вопрос
0
Ваш ответ на вопрос
Войдите, чтобы написать ответ
Войти через центр авторизации
Похожие вопросы
Базы данных
+3 ещё
Средний
Неправильное поведение пула соединений в приложении Spring Boot — почему соединения не возвращаются?
1 подписчик
вчера
62 просмотра
1
ответ
Node.js
+2 ещё
Простой
Как сделать регистрацию без слета через fs?
1 подписчик
03 июн.
80 просмотров
2
ответа
Базы данных
+1 ещё
Простой
Какую базу данных нужно использовать для телеграмм бота?
1 подписчик
10 мая
4717 просмотров
9
ответов
IT-образование
+1 ещё
Простой
С чего начать изучение инженерной части БД?
2 подписчика
23 апр.
321 просмотр
3
ответа
Python
+2 ещё
Простой
Корректно ли в данном случае отправляется запрос в базу данных?
1 подписчик
23 апр.
197 просмотров
2
ответа
Базы данных
Простой
БД для дискорд-бота?
1 подписчик
17 апр.
132 просмотра
1
ответ
Android
+4 ещё
Простой
Какие ресурсы нужны для разработки AR приложения на Unity для «оживления» фото в школьном альбоме?
1 подписчик
17 апр.
215 просмотров
1
ответ
Базы данных
Простой
Какие есть утилиты для автоматизированного проектирования БД?
3 подписчика
02 апр.
2719 просмотров
5
ответов
Базы данных
Простой
RBAC: когда создавать нового пользователя в ДБ?
2 подписчика
26 февр.
199 просмотров
1
ответ
Математика
+2 ещё
Сложный
Применение тензоров 4-го ранга в лингвистике и биоинформатике: возможности и ограничения?
1 подписчик
16 янв.
168 просмотров
0
ответов
Показать ещё
Загружается…
Вакансии с Хабр Карьеры
Специалист по качеству данных
ГК «Интерлизинг»
•
Санкт-Петербург
от 150 000 ₽
Администратор баз данных PostgreSQL
HR Prime
•
Москва
от 260 000 до 350 000 ₽
Дежурный администратор баз данных (MSSQL DBA)
Автомакон
•
Москва
от 200 000 до 300 000 ₽
Минуточку внимания
Войдите на сайт
Чтобы задать вопрос и получить на него квалифицированный ответ.
Войти через центр авторизации
Закрыть
Реклама