Секвенированные геномы. Откуда достать?

Question

[cthulhudx]

Скажите пожалуйста, есть ли базы геномов + исходных ридов. Пишу(для себя) геномный ассемблер, и мне нужно на чем-то проверять его работоспособность.

Answer 1

[Владимир Мартьянов]

www.ncbi.nlm.nih.gov/genome - оно? Если да - проверяйте настройки гугла, ибо это первый результат по запросу "genome database"

Answer 2

[Артур К.]

www.ncbi.nlm.nih.gov
ncbi + подразделы

Answer 3

[Александр Резвых]

ftp://ftp.ensembl.org/pub/

Выбираешь любой релиз и папочку FASTA. А смотря какой геном нужен. Если нужны риды (формат *.fastq) - искать в публикациях по таким темам, это в NCBI. Если какие-то собранные/недособранные геномы - это в ensembl всё есть.