Если хочется совсем уж простоты, штуки 3 типовых скрипта для bash, плюс простейшая вебморда exec`ающая эти скрипты.
Пример скрипта:
pastebin.com/eTwyAx23 (юзается на VPS`е, может быть кривовато)
Добавление пользователя для FTP с nologin, создание диры для сайта, VHOST`a для апач и юзера в MySQL. Работает в CentOS. По аналогии можно накропать аналогичных для базовых функций.