Pixel Perfet нужен только в том случае, если дизайнер об этом просит. Если каждый пиксель на счету и должен иметь свое место, то, пожалуй да, этим можно заморочиться. Но во всем должен быть разумный предел. Как отметили выше, есть разные браузеры, разные системы, разные методы рендера. Пытаться бороться с этим не вижу смысла, это впустую потраченное время. Это должен понимать и сам дизайнер, когда выдвигает такие требование к макетам.
Если же дизайнер рисует все «на глаз», то, естественно ни о каком PP речи быть не может. Бывали верстальщики, которые делали PP с кривых макетов, например, у одного элемента 27px отступ, у другого 24. И так с каждым элементом. Возьмите и выравнивайте до 25, зачем дублировать ошибки дизайнера? Думайте своей головой, а не «так было в макете».