Мне больше всего симпатична возможность включения двухфакторной аутентификации на портале Госуслуг - ровно то, о чем maaGames написал. Это может быть и не "лучший способ", поскольку неясны критерии, но он действительно удобный, неплохо защищает вашу учетную запись от взлома, а также дешев (почти у каждого есть телефон).
Ради портала госуслуг я бы не стал покупать средство электронной подписи. Жаль, что разработчики портала не поддержали генераторы разовых паролей типа Google Authenticator (в дополнение к обычным паролям) - если бы была такая возможность, то я бы рекомендовал именно этот вариант.