1. какие скрипты? JavaScript ?
2. в проект VS они добавлены? прописаны? если они просто в папке лежат - то через публикацию в сеть - они не будут скопированы.
javascriptы прописаны.. возникла еще проблема. сайт находится в wwwroot/test, и все файлы там. но при загрузке внутренних страниц он грузит с wwwroot, а не с test folder..