Если запустить python file.py start id1 cmd 01, то эти аргументы запускаются по одному, как сделать так чтобы cmd 01 выполнялись не по отдельности cmd и 01 а вместе "cmd 01" Извините за формулировку, я новичок в программировании...
Используйте кавычки "cmd 01" или слэш перед пробелом cmd\ 01.
Или парсите аргументы по очереди и следите за тем какие аргументы являются составными и объединяйте их корректным образом.