Для того чтобы удалить первые N символов, в разделе «Режим поиска» отмечаем пункт «Регуляр. выражения», а в поле «Найти» вставляем:
^.{2}(.*)$
«2» здесь – это количество необходимых символов, которое необходимо удалить.
Как с помощью Notepad++ удалить первые/последние N символов каждой строки?
Нижнее же поле «Заменить на» заполняете:
$1
и жмете «Заменить все».