Кратко - да.
Долго - зависит от использования. Если на основании значения вы динамически подключаете файлы, или выводите значение на страницу - то да, если же проверяете, например, регуляркой на наличие там какой-то подстроки, то можно и не проверять.
Фильтровать нужно всё, что участвует в выводе на страницу, ну и эскейпить строки при вставке в БД.