Глобально - через отправку клиенту
заголовка, фича относительно новая (прошли годы как приняли) но по уму должна поддерживаться уже всеми. Чистит все, для веб сайта и его поддоменов, не думаю что это красиво делать регулярно, но как фосмажор - почему нет.
Ну а исторически, проблема кеширования при обновлении веб приложений решается заранее, имя файла (или добавлять ?xxx к ссылке) должно содержать хеш от его содержимого, т.е. все файлы проекта (те что в html коде, т.е. js и css) перед деплоем должны пройти переименование и соответствующую правку когда/шаблонов в местах, где переименованные файлы используются.
