Приведённые варианты на это практически никак не влияют. При масштабировании используется максимальная автоматизация всего и вся - так что тут без разницы как именно запущен веб сервер. И то и другое автоматизируется одинаково хорошо. На настройку nginx это тоже не влияет никак - конфиг в обоих случаях будет либо в гит-репозитории лежать либо где-то в веб-интерфейсе системы автоматизации развёртывания ПО. Важнее - как именно организовано сопровождение веб-сервера и удобство его управлением.