У меня два разных проекта и у них отличается интерфейс. Как это изменить и с чем это связано?
Мне не нравится 3д вид, хочу чтоб всё было 2д и без такого некрасивого выделения в ListBox.
Это стандартный вид стандартных окон ОС Windows. Не нравится стиль - всегда можно нарисовать свой. WinForms использует древнее легаси API GDI+. Есть еще WPF, MAUI - там уже более новое. У вас какой именно вариант? Там немножко по-разному стили задаются. При желании можно нарисовать все что угодно. Ко всему есть подробнейшие мануалы в сети.
Внешний вид контролов в winform зависит от настроек системы, если не нравится, можно поковырятся в стилях отрисовки, но это не просто, также есть доп. контролы(коммерческие) , которые позволяют управлять внешним видом контролов.