Если ставить Apache x64, то нужно и php x64 ставить (так как он обычно как модуль апача ставится), что касается MySQL без особой разницы (я предпочитаю ставить x64, родной для ОС).
В php есть специфика касающаяся несовместимости некоторых функций в 32 и 64 битных версиях (связано в первую очередь с тем что в первом случае signed int32 в во втором signed int64 для чисел используется).
Например, функции crc32, ip2long и т.п. разные результаты выдают. В общем бывают веселые глюки.
Для локалхоста вообще можно заюзать одну из сборок, типа VertigoServ, XAMPP, EasyPHP и т.п.