Нет, смысла нет вообще.
Более того, это немного вредно - отключение keepalive позволяет php-fpm тушить ненужные треды (и высвобождать память), вместо того, чтобы оставлять их (ибо они как keepalive держат). Правда, fpm обязан уметь держать keepalive мастер-процессом (точнее, "переносить" такие коннекты на мастер-процесс со временем). Вопрос только в том, научился ли fpm корректно это делать =)
Вот с апачем позади keepalive точно нужно выключать.