Мне сложно говорить именно про VPS для личного использования, но в случае "условного хостера", когда есть отдельный сервер и на нём будут размещаться клиенты, указывать надо ваше "типовое имя сервера" в духе
server100500.moysuperhost.ru
. Т.е. то, на что будет выпускаться SSL-сертификат для сервера, и то, что будет в т.ч. и УРЛом, на который будут заходить клиенты для управления своими активами.
Соответственно, если домен у вас будет один, то вероятнее всего, правильный вариант -
domain.com
.
mail.domain.com
, насколько я помню, может использоваться по-разному в разных панелях и разных назначениях/конфигурациях сервера. В моём понимании вашего вопроса, этот вариант вряд ли хоть насколько-то разумен.
Я хочу избежать любых потенциальных конфликтов с доставкой электронной почты
Опять же, возможно, это у меня недостаток знаний, но источник возникновения такого конфликта я представляю с трудом.