Так как вопрос общий и не конкретизирует будущую работу и выбор ОС, то настоятельно рекомендую почитать про сети и типовые конфигурации, с ними больше всего работы и она универсальна, для любой ОС.
Следующий кандидат на изучение IPC (Inter Process Communication), мультипоточность, синхронизация, семафоры, мьютексы и т.п. Можно полистать про пайпы, они по разному работают в разных ОС т в каком то смысле это одновременно и сети и IPC.
До кучи - работа со временем, не совсем ОС но она чуть чуть может отличаться от ОС или выбранного фреймворка.
Ну и совсем голая практика - работа с GUI, базовые отличия и особенности (например почему в linux GUI это сервер, или почему в windows, 'схватив' заголовок окна мышкой, можно поставить на паузу стартовый поток).
Судя по вопросам да и вообще, очень многим не хватает базовых знаний в этой области, применимость, конкретной практики. Какой только маразм не изобретают...
