пакет стандартной версии nginx-core устанавливает испоняемый бинарь програмки в /usr/sbin/nginx
и имеет в зависимостях пакет настроечных файлов nginx-common который распихивает кучу настроек по соответствующими путям.
что еще непонятно ?? :)
Во первых он не устанавливается в etc.
В этой папке лежит только его конфиг, и сценарии запуска.
Как и у большинства стандартных программ в любом линуксе.
Во вторых куда он установится можно посмотреть распаковав .deb архив.
В третьих если не пользоваться стандартной установкой его вообще можно куда угодно поставить.
Чтобы в этом что-то понимать - почитайте информацию про организацию файлов в линуксе.
Средний
