Очень много. Практически все современные NoSQL-in-memory-dbms используют хеш-таблицы в каком-то варианте.
Хеш-таблицы являются частью механизма буферного кеша (страничного кеша) в дисковых БД. В Oracle, Postgres e.t.c.
Сам буферный кеш включает в себя структуры данных LRU поэтому можно сказать что LRU использует хеш-таблицы.
Дисковые файловые системы могут использовать хеш-таблицы (в зависимости от настроек). Как хранить списки файлов в директориях. Там кажется выбор есть. Дерево или хеш-табличка.