В C.I. внезапно нет модулей, это не HMVC фреймворк. Есть костыль под названием "пакеты приложений" через $this->load->add_package_path(), он позволяет сделать группу из вьюх, контроллеров, хелперов и конфигов путем хардкора пути к загрузчику классов; модульностью это можно назвать с большой натяжкой.
Ищите любую библиотеку, которая выполняет нужный функционал и "интегрируейте" в фреймворк через тупой инклуд.
Смотря что вы имеете ввиду под понятием модуль, если что то вроде бандлов то getsparks.org
если модуль для Вас динамический блок страницы сайта то поищите библиотеку или напишите свою. Вообще фраймворк очень хорошо подходит под "затачивание" под свои нужды.
Простой
