Смотря какой доступ. Смотря из-под какой учетной записи запущена программа.
Доступ к планировщику задач есть у всех, пользователь может создавать новые задачи, удалять старые и т.п.; доступ к реестру к пользовательской ветке есть у пользователя полный, к ветке HKLM - на чтение, к некоторым разделам доступ ограничен; автозапуск - это просто ветки реестра и каталог "Strtup" в меню пользователя, соответственно права доступа зависят от нахождения ветки/каталога - если это пользовательский реестр или меню, то доступ полный, если системный - на чтение; доступ к службам у обычного пользователя на чтение есть, на запись требуются админские права.
Если есть доступ у пользователя, то есть доступ и у любых программ, запущенных под этим пользователем.
