Почему странно? Вы приведите пример конкретной фабрики и напишите, почему считаете такой подход неправильным. Любой паттерн можно использовать как угодно, вопрос в том, справится ли он с поставленными задачами и будет ли это удобно следующему программисту в будущем.
Из вашего вопроса не очень понятно, как именно фабрики использовались. Применение в сервисах мне сложно представить на лету, но в контроллерах они могу отвечать за сложную логику со связанными моделями, где есть куча входных данных и несколько выходных моделей или отношений.
ОБНОВЛЕНИЕ
Если вопрос не про паттерн, а про
Eloquent Factories как заметил
Дмитрий то использование их вне тестовой среды ошибочно само по себе. Так как эти фабрики созданы для тестирования и сидирования, а не для боевого использования. Я уже молчу о том, что таким образом есть шанс, что "фейковые" данные просочатся в продакшен. Для исключения этих сложностей и существуют fillable и guarded свойства моделей, которые не учитываются в фабриках, насколько я знаю.
