У меня есть цикл while в коде, в котором происходит обработка данных, и пишется время выполнения отдельных операций, но из-за постоянного вывода читать неудобно, как сделать вывод через секунду - две?
Не совсем понятно. Вам вместо постоянного вывода в консоль нужно чтобы каждую секунду-две простыню лога вываливало?
Или нужно пропускать какие-то данные, и выводить актуальные данные с периодом в секунду-две, пропуская все остальные?
Заноси куда нибудь время , в которое должно будет выполняться какое либо условие. А потом проверяй в своем цикле настоящее время и то которое ты заносил , если они равны то выполнять код.