Потому что PS F:\it\test> это PowerShell который по умолчанию не подхватывает виртуальное окружение после его активации, а сверху дефолтный CMD который это делает. В настройках Pycharm можно задать с какой оболочкой работать. И я уверен, что PowerShell можно соответствующим образом настроить чтобы он сам активировал виртуальное окружение.
UPDATE: Здесь есть решение твоей проблемы.