Я из таблице (№1) методом checbox отбираю нужные позиции по id (их может быть любое количество) и отправляю данные id методом post, в обработчик php, данные получаю в массиве $id = $_POST['id'];
И вот вопрос? как мне полученный массив из id таблицы №1 записать в столбец в таблицу №2
сначала надо сделать var_dump($id) и показать результат
потому что между абстрактными рассуждениями "отбираю, отправляю, получаю" и реальным содержимым переменной может быть пропасть
foreach($_POST['id'] as $key => $id);
$id_shipments = $_POST['id_shipments'][$key];
// и так далее
$stmt->bind_param("ss", $id, $id_shipments);
$stmt->execute();
}