Логирование и синхронизация точного времени на сервере и клиенте.
Точный момент (миллисекунды), когда запрос 'пришел' на сервер зависит от точки, в которой происходит замер, например если замерять средствами nginx (запущенный на сервере) и к примеру момент, когда запустится cgi скрипт (первой строчкой которого поставить запись времени в лог) - будут отличаться на десяток миллисекунд.
Причина в том, как именно запрос обрабатывается, асинхронно или нет (скрипт может принять его либо в тот момент как пришел первый сетевой пакет, или же с последним).