Нужно перегнать мануалы с сложной структурой, хранящиеся в html/css/js-файлах плюс картинки, в один файл, с сохранением навигации.
HTA и CHM не подходят по разным (внутренним) причинам, так же как и исполняемые (.exe) файлы.
Идеально - в pdf с сохранением ссылочности.