Вы явно используете PhpStorm неправильно. Создавайте проект, пользуйтесь поиском по классу Alt+Shift+N, файлу Ctrl+Shift+N, и прочими прелестями навигации вроде перейти к объявлению, использованию.
Если вы открываете файлы с проводника, может вам достаточно Sublime Text.