Подсветка не странная. Так отображаются файлы, исключенные из проекта. Либо через меню самого шторма, либо в файле гитигнор.
Как видно у вас весь проект исключен.
Либо нечаянно. Либо глюк.
Можно убрать из excluded правой кнопкой по папке
Если глюк, попытайтесь сделать инвалидацию кэша.
В крайнем случае закрыть проект, удалить папку .idea, открыть проект заново.
При этом сбросятся все локальные настройки данного проекта.