Данных достаточно мало, я решил провести тесты. Сделано 4 террейна(с разными террейн датами) размера 10 на 10 на 60, 1 покрыт только материалом(была попытка наложить текстуры на него, они не накладываются), 2 только текстуры положил, 3 только материал(он изначально такой), 4 ничего(тут только квадратики исчезли, что вполне логично). Советую сделать на террейне базовый материал и просто покрыть текстурами, как тебе нужно. Это может сработать. Если не сработает, то скинуть людям на рассмотрение скрины того что у тебя там вообще.